苗栗縣政府調查科學園區員工子女就學需要及因應賴清德總統政見「大矽谷推動方案」，評估園區人口必然持續上升，教育需求倍增，苗栗縣建請國科會竹科管理局於竹南科學園區推動園區內設立科學實驗中學，新設高中部、國中部、國小部、雙語部及幼兒園五學制，以提供竹南科學園區、銅鑼科學園區、國家衛生研究院及新竹科學園區外溢等員工子女學童就讀。
竹南科學園區86年奉行政院核定為科學園區用地，土地面積123公頃及銅鑼科學園區總面積約350公頃支援新竹科學園區發展，至今20餘年來已有效核准74家廠商以及70家廠商登記進駐，113年10月統計員工數已達1萬9,994人，人數持續增加。同年11月苗栗縣教育處調查竹南鎮及頭份市地區所屬之幼兒園之家長服務於園區者有2,370人及國中小有5,574人，子女教育需求逐年擴大。
另依照113學年度新竹科學園區實驗中學招生資訊顯示，幼兒園錄取35人，有174人備取；國小正取108人，備取30人；國中正取58人，備取20人，顯見員工子女就學需求大於供給，新竹科學實驗中學未能滿足園區廠商員工子女教育需求。
因此苗栗縣政府為同時解決新竹科學實中就學需求及竹南、銅鑼科學園區廠商員工持續增加而衍生的子女教育需求，苗栗科學實驗中學設立迫在眉睫，建請國科會於竹南科學園區設置科學實驗中學，提供廠商就業人員子女安心就學的環境，選址擇定大同高中南側、省道臺13線(公義路)以東之非都市土地約9公頃。
該基地位於園區中心位置，鄰近國道1號頭份交流道、國道3號竹南交流道與台61線西部濱海快速公路，方便園區員工接送就學子女，以符合教育部推動高中社區化及苗栗縣學子實質平等的就學選擇權，有利於吸引廠商進駐及員工招募，帶動苗栗地區經濟發展。
